Οι στρατηγικοί στόχοι της έρευνας του ΠΜΣ είναι οι εξής:
- Προαγωγή της έρευνας στα πεδία ενδιαφέροντος του ΠΜΣ ΑΔΟΑΠ
- Περαιτέρω ενίσχυση της εξωστρέφειας του ΠΜΣ με την συνέχιση της ανάληψης ερευνητικών εργασιών με πρωτογενές υλικό.
- Διασύνδεση της έρευνας με τις ανάγκες των τοπικών κοινωνιών, μέσω συνεργασιών με δημόσιους φορείς και οργανισμούς (πρωτότυπες ερευνητικές μελέτες, συμμετοχή σε συνέδρια, κ.λπ.)
- Ενίσχυση συνεργιών μελών ΔΕΠ του ΠΜΣ για κοινά ερευνητικά έργα, δημοσιεύσεις, συμμετοχές σε συνέδρια, κ.λπ.
- Ενίσχυση της ερευνητικής δραστηριότητας των συνεργαζόμενων εργαστηρίων του ΠΜΣ και ένταξη μελών ΔΕΠ σε ερευνητικές ομάδες ανάλογα με τα αντικείμενα έρευνας.
- Ενίσχυση ερευνητικού εξοπλισμού του ΠΜΣ και των εργαστηρίων με την προμήθεια, λογισμικού και εξοπλισμού.